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A l’occasion de la Journée mondiale contre le cancer, le 4 février prochain, l’Institut Curie, acteur de référence dans la lutte contre le cancer, revient sur les enjeux autour du big data et de l’intelligence artificielle. Une révolution annoncée pour améliorer la recherche en cancérologie et le traitement des personnes malades, amorcée avec la remise du rapport Villani et la visite du Président de la République qui s’en est suivie à l’Institut Curie fin mars 2018. Le développement de l'intelligence artificielle est appelé à transformer en profondeur les pratiques en santé : aide au diagnostic, aide à la décision thérapeutique, suivi évolutif du patient… dans le but d'être utile aux patients, de les traiter plus efficacement et de limiter les effets secondaires.
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L'Institut Curie, un allié essentiel de la transformation numérique
Les grands centres hospitaliers à travers le monde ont un rôle majeur à jouer dans le développement des technologies numériques car ils concentrent les bases de données les plus riches et les plus proches de la réalité clinique. C’est le cas à l’Institut Curie, riche de 500 000 dossiers patients et pionnier dans l’informatisation des données cliniques. Que ce soit dans le domaine de l’aide au diagnostic, de la prédiction de la réponse au traitement ou pour mieux déterminer le risque de récidive, l’Institut Curie a développé de nombreux partenariats avec des start-up et des industriels sur des enjeux médico-scientifiques majeurs : imagerie médicale, radiothérapie, séquençage du génome… Une évolution numérique qui amène à réfléchir aux enjeux de telles pratiques et à développer une approche éthique : qui possède les données ? Qui peut les utiliser ? A quelles fins ? Comment sont-elles protégées ? Le sujet de la responsabilité de ces outils dans la décision médicale est primordial. Car si l’erreur est humaine, comment gérer d’éventuelles erreurs de la machine ?
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 Il est indispensable de recenser et faire communiquer les données dispersées dans différentes bases. C'est un enjeu majeur ! Que ce soit dans l’hôpital, entre la recherche et l’hôpital ou entre différents établissements. 
souligne Xosé Fernández,
directeur des data de l’Institut Curie.
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Une direction des data créée à l'Institut Curie
Afin de mieux faire face à cet avènement numérique et de gérer notre transformation numérique, l'Institut Curie a créé une direction des data en 2017.
Transversale, cette nouvelle direction dirige la stratégie et pilote la transformation numérique institutionnelle. Pour cela, elle structure et valorise l’ensemble des données dans l’objectif de multiplier les collaborations et les recherches. La création de cette direction a été possible grâce à la générosité des donateurs.
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En pratique : l’IA au service de la médecine de précision
La médecine de précision des cancers vise à mettre en place des traitements adaptés aux caractéristiques génétiques de chaque patient. Pour que davantage de patients aient accès à des thérapies ciblées, les établissements hospitaliers doivent rationaliser à la fois la production et l'utilisation de leurs données, ce qui nécessite le recours à des technologies de pointe utilisant l’intelligence artificielle et le calcul à haute performance.
En imagerie médicale, l’Institut Curie a signé un partenariat avec le programme d’interprétation automatique d’images Therapixel qui exploite le deep learning afin de détecter les tumeurs et les signes avant-coureurs de cancer sur les mammographies.
L’Institut Curie fait par ailleurs partie des 4 centres pilotes qui ont participé à la conception du projet ConSoRe depuis 2012 et qui dispose de l’outil en phase de test depuis fin 2016. Lancée par Unicancer, la plate-forme ConSoRe vise à poser des requêtes simples ou complexes sur les données en texte libre du système d’information et à naviguer dans les centaines de milliers de dossiers patients pour en extraire rapidement des données structurées, les analyser et les partager entre les CLCC.
L’objectif de la démarche est d’apporter au patient et à ceux qui le prennent en charge, médecins et équipes soignantes, des outils et des indicateurs dont ils n’auraient pas pu disposer sans l’apport de l’IA. Ce que l’on résume au travers de la formule : « Le praticien augmenté »
Découvrez les projets en cours
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 L’utilisation des données de grand volume couplée à l’utilisation d’algorithmes issues de techniques d’IA va révolutionner la compréhension du cancer. Nous disposons d’un nombre suffisant d’images médicales annotées pour concevoir des algorithmes permettant d’aider au diagnostic, de mieux établir le pronostic ou de prédire la réponse au traitement. Les premiers résultats sont étonnants car l’ordinateur « voit » sans se poser de questions, sans a priori, sans se fatiguer, alors que le radiologue ou le pathologiste ne regardent que ce qu’ils cherchent. 
explique le Dr Alain Livartowski,
oncologue médical et directeur adjoint des datas pour l’Ensemble hospitalier de l’Institut Curie.
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Un des enjeux majeurs : avoir des données de qualité, structurées et exploitables
L’exploitation de ces nouvelles technologies de pointe soulève également de nombreuses questions : à la fois d’ordre juridique comme l’accès aux données, les problèmes de confidentialité et de consentement du patient ; mais aussi d’ordre technique comme la qualité des données sources, leur interopérabilité et leur intégration.
L’utilisation d’infrastructures numériques implique la capacité de relever le défi en termes de recueil, collecte, hébergement, indexation et export des données dans un format interopérable, chacune de ces dimensions constituant un impératif singulier.
Les défis majeurs de l'IA
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 Il est indispensable de travailler sur des grandes masses de données : recenser et faire communiquer les données dispersées dans différentes bases est un enjeu majeur, dans l’hôpital, entre la recherche et l’hôpital, entre différents établissements…
C’est aujourd’hui possible grâce à des outils, des protocoles informatiques qui permettent de créer des passerelles entre les différents systèmes et de formuler les informations de part et d’autres de façon structurée.
L’accord signé en mai 2017 avec Owkin permet par exemple le traitement automatique de données médicales en cancérologie, se réjouit Xosé Fernández.  |
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Parallèlement aux données cliniques, l’évolution de la biologie et des sciences du vivant en général s’accompagne de volumes de données en croissance exponentielle. L'Institut Curie, qui a créé la plateforme francilienne SeqOIA aux côtés de l'AP-HP et de Gustave-Roussy, se dote de capacités croissantes en bioinformatique.
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La capacité à attirer et à conserver des talents que tout le monde s’arrache est cruciale, explique Emmanuel Barillot, directeur de l’unité de bio-informatique « Cancer et Génome » de l’Institut Curie, qui est passée de 5 à 100 personnes en 15 ans. En s’enrichissant des données des quelques 18 000 génomes séquencés chaque année en routine et en les partageant au niveau national et supranational, la plate-forme SeqOIA permettra d’entrainer des algorithmes qui pourront améliorer en continu la prédiction des effets d’une thérapie pour le patient.
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10 millions d’euros pour développer les datas et l’intelligence artificielle afin de lutter contre le cancer
L’Institut Curie mène une ambitieuse campagne de levée de fonds auprès de grands donateurs et entreprises pour soutenir 4 projets d’avenir contre le cancer dont le développement des datas et de l’intelligence artificielle.
Avec un comité de campagne, l’Institut Curie souhaite lever 21 millions d’euros de dons d’ici 2021 dont 10 millions pour le projet des datas.
explique le Pr Thierry Philip,
président du directoire de l’Institut Curie.
Pour en savoir plus découvrez La campagne Vaincre le cancer
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Quelques chiffres sur l’Institut Curie
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A propos de l’Institut Curie
L’Institut Curie, acteur de référence de la lutte contre le cancer, associe un centre de recherche de renommée internationale et un ensemble hospitalier de pointe qui prend en charge tous les cancers y compris les plus rares. Fondé en 1909 par Marie Curie, l’Institut Curie rassemble sur 3 sites (Paris, Saint-Cloud et Orsay) 3 400 chercheurs, médecins et soignants autour de ses 3 missions : soins, recherche et enseignement. Fondation privée reconnue d’utilité publique habilitée à recevoir des dons et des legs, l’Institut Curie peut, grâce au soutien de ses donateurs, accélérer les découvertes et ainsi améliorer les traitements et la qualité de vie des malades. Pour en savoir plus : www.curie.fr
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